Deep Mind publica “Building Blocks of Life” como código abierto

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La empresa hermana de Google, AlphaFold, afirma haber comprendido todas las proteínas del organismo humano con la ayuda de la inteligencia artificial.

La estructura de las proteínas, los bloques de construcción básicos de cada organismo, ha sido durante mucho tiempo un misterio para nosotros los humanos. Cuando las células producen proteínas, encadenan innumerables aminoácidos en una cadena larga que finalmente se pliega entre sí. Este pliegue es diferente para cada proteína y determina cómo funcionan las proteínas en una célula, si son bondadosas o dañinas, y si la célula está funcionando correctamente.

Esta decodificación de pliegues de proteínas se ha considerado durante mucho tiempo como uno de los mayores desafíos en biología. Hasta ahora, los pliegues de proteínas individuales solo se han podido muestrear y monitorear con el trabajo más minucioso y detallado. Pero el año pasado, después de todo, la startup de inteligencia artificial Deep Mind, un grupo alfabético como Google, celebró un punto de inflexión y ahora quiere compartirlo con el mundo.

En el marco del proyecto Alphafold, Deep Mind ha predicho en los últimos años la estructura de las proteínas basándose en secuencias de aminoácidos individuales utilizando inteligencia sintética basada en el aprendizaje automático. En noviembre pasado, el lanzamiento presentó sus resultados recopilados por primera vez, que superaron incluso las peores expectativas: en un experimento combinado, Alphafold pudo predecir la estructura de 100 secuencias de proteínas entregadas en 70 casos. Ensayos experimentales. Cuando se trata de la diferencia entre la configuración calculada y real, Deep Mind promedió más de 90-100. En otras palabras: la IA estaba cerca del pliegue real.

Los responsables ahora estiman que han predicho aproximadamente el 98,5 por ciento de los pliegues proteicos en la proteína humana, es decir, todas las proteínas del organismo en su conjunto, lo que resulta en un beneficio médico y científico específico. Los investigadores no tienen que empezar de nuevo para cada proteína, pero pueden utilizar los pliegues previstos como base.

El Base de datos completa de proteínasMientras tanto, creada por Deep Mind, la startup ahora está disponible para el mundo como código abierto. Contiene casi la totalidad de las 20.000 proteínas expresadas por los seres humanos, así como las estructuras de unos 20 organismos más, como las bacterias de levadura y E. coli. En total, hay alrededor de 350.000 proteínas en la base de datos, lo que hace que la base de datos sea la más grande y la mejor hasta la fecha. Más lejos Hay un papel, En el que se explica en detalle el proceso de la IA básica.

Deep Mind, que ha trabajado con el Laboratorio Europeo de Biología Molecular, espera que la base de datos ayude a los investigadores a estudiar cómo funciona la vida a nivel atómico. Necesitan descubrir cómo se desencadenan las enfermedades, cómo se pueden personalizar los medicamentos y cómo las “enzimas verdes” pueden romper el plástico algún día.

“Los biólogos estructurales no están acostumbrados a ver todo en unos pocos segundos porque se necesitan muchos años para determinar estas cosas de forma experimental”. El CEO de Deep Mind, Demis Hasabis, dice en una entrevista con TechCrunch. “Creo que esto conducirá a enfoques completamente nuevos para resolver preguntas abiertas y nuevos experimentos”.

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